Stephane Jedele

Experience

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  ESRF - The European Synchrotron

  Jun 2018 - Jul 2018

  Étudiant stagiaire - Projet de recherche, Radiothérapie Stéréotaxique

  Sujet : Etude de traitements de cellules cancéreuses par rayonnement synchrotron couplés à l'incorporation de métaux lourdsMots-clés : Gliomes, Rayonnement Synchrotron, SSRT, Nanoparticules, ClonogénicitéLaboratoire d'accueil : ESRF GrenobleÉquipe d'accueil : Rayonnement Synchrotron et Recherche Médicale (RSRM)Encadrante : Pr. Anne-Marie CHARVETDescription : L'objectif de l'étude est de quantifier l'effet cytotoxique de nanoparticules de métaux lourds dans les cellules cancéreuses exposée à un rayonnement synchrotron.Des cellules de gliomes de rats ont été cultivées puis incubées ou non avec des nanoparticules de métaux lourds.L'état des cellules (aspect et taille) et leur nombre ont été suivis au cours du temps par microscopie et l'utilisation d'un logiciel de traitement d'image. Mostrar menos

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  Linköpings universitet

  Jun 2019 - Jan 2019

  Étudiant stagiaire - Projet de recherche, Bioinformatique Translationnelle

  Sujet : Integration of Transcriptomic and Methylomic Modules for Evaluating Genomic Concordance in Multiple SclerosisMots-clés : Multiple Sclerosis, Modules, Gene Expression, Gene Methylation, MODIfieRLaboratoire d'accueil : Department of Physics, Chemistry and Biology (IFM) at LiUEquipe d'accueil : Division Bioinformatics (BION)Encadrants : Pr. Mika GUSTAFSSON / Tejaswi BADAMDescription : L'objectif de cette étude est d'identifier des groupes de gènes fortement associés (modules) dans la maladie de la sclérose en plaque en utilisant des approches statistiques.Les profils d'expression et de méthylation de patients atteints par la maladie ont été sélectionnés et récupérés sur le dépôt de données génomiques GEO (Gene Expression Omnibus).Les données récupérées ont ensuite été analysées indépendamment en utilisant le package R MODifieR mis au point par l'équipe puis croisées entre-elles.La pipeline de récupération, d'analyse et d'intégration des données a été développée sous R. Mostrar menos

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  Université de Nantes

  Feb 2020 - Jul 2020

  Étudiant stagiaire - Projet de recherche, Dynamique Moléculaire

  Sujet : Étude de l'effet de la membrane mitochondriale sur la dynamique de l'anti-apoptotique Bcl-xL par modélisation moléculaireMots-clés : Bcl-xL, Dynamique Moléculaire, Apoptose, Modifications Post-Traductionnelles, MembraneLaboratoire d'accueil : Unité Fonctionnalité et Ingénierie des Protéines (UFIP, UMR CNRS 6286)Encadrant : Pr. Stéphane TELETCHEADescription : L'objectif est de comprendre comment les lipides de la membrane mitochondriale contribuent à la dynamique de Bcl-xL, molécule clé de la régulation de l'apoptose.Plusieurs versions de la protéine sauvage et modifiées (phosphorylation/déamidation) ont été modélisées dans une bicouche lipidique.Des simulations de dynamique moléculaire de ces systèmes ont été réalisées en utilisant le logiciel AMBER.L'étude s'est focalisée sur l'orientation de la protéine à la membrane et les interactions protéines-lipides.Les trajectoires de la protéine ont été analysées en utilisant AmberTools et le package python MDAnalysis Mostrar menos

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  Université Paris Cité

  Oct 2020 - now

  Étudiant doctorant

  Sujet : Étude de l'interaction de deux canaux ioniques impliqués dans la déshydratation des globules rouges chez des patients atteints de xérocytose héréditaire par des approches de modélisation moléculaireMots-clés : -Laboratoire d'accueil : Biologie Intégrée du Globule Rouge (BIGR, Inserm UMR_S1134)Équipe : Dynamique des Structures et Interaction des Molécules Biologiques (DSIMB)Encadrante : Pr. Catherine ETCHEBESTDescription : -