María Del Pilar Ramos Bratos

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Alumna interna

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  • Timeline

  • About me

    Bioinformática Junior - Analista de datos ómicos

  • Education

    • Universidad de Sevilla

      2017 - 2021
      Grado en Biomedicina Básica y Experimental Ciencias biológicas y biomédicas

      Conocimientos teóricos de distintos campos biológicos y clínicos como genética, bioquímica, microbiología, inmunología, fisiología, patología, neurología…Soltura en técnicas como:- Electroforesis de proteínas- Cromatografía en columna- Cromatografía en papel- Siembra de bacterias Realización de prácticas de investigación y Trabajo Fin de Grado “Papel del receptor de la UPR IRE-1 en la recuperación tras la quiescencia en L1 de Caenorhabditis elegans”.

    • Universidad Internacional de Andalucía

      2021 - 2022
      Máster en Análisis de datos ómicos y biología de sistemas Biomatemática, bioinformática y biología computacional

      Obtuve autonomía en las ciencias “ómicas”: - Genómica o Preprocesamiento de datos crudos o Ensamblaje y anotación de genomas procariotas (PacBio, Nanopore) o Secuenciación de amplicones o Reconstrucción y análisis de redes metabólicas a escala genómica - Transcriptómica o Análisis de datos basados en microarrays (affy, affyPLM, limma) o Análisis de datos RNA-seq: control de calidad, construcción de índices de genomas de… Mostrar más Obtuve autonomía en las ciencias “ómicas”: - Genómica o Preprocesamiento de datos crudos o Ensamblaje y anotación de genomas procariotas (PacBio, Nanopore) o Secuenciación de amplicones o Reconstrucción y análisis de redes metabólicas a escala genómica - Transcriptómica o Análisis de datos basados en microarrays (affy, affyPLM, limma) o Análisis de datos RNA-seq: control de calidad, construcción de índices de genomas de referencia, mapeo de lecturas, ensamblaje de transcritos, cuantificación de transcritos (HISAT2, bowtie2, StringTie, ballgown). o Análisis de datos ChIP-seq, ATAC-seq (MACS2, CHIPseeker, HOMER). o Anotación funcional basada en ontología génica en términos GO y rutas KEGG (clusterProfiler) o Redes de coexpresión génica (WGCNA, CytoScape) - Proteómica - MetabolómicaTrabajo Fin de Máster "Regulación cooperativa de la expresión génica por DAF-16 y HLH-30 durante el arresto L1 en Caenorhabditis elegans". Mostrar menos

  • Experience

    • Universidad de Sevilla

      Feb 2021 - Sept 2022
      Alumna interna

      Durante mi estancia, obtuve experiencia práctica e interpretación de distintas técnicas:- Cruce de líneas y generación de mutantes C. elegans. - Nematode Growth Medium (NGM)- Técnica “bleaching” (extracción de embriones a partir de gusanos grávidos)- Polymerase Chain Reaction (PCR)- Electroforesis de ácidos nucleicos- Medición de bioluminiscencia

    • Universidad de Sevilla

      Mar 2023 - Jun 2023
      Estudiante en prácticas

      Realización de prácticas de laboratorio en el departamento de Microbiología de la Facultad de Biología. - Preparación de medio LB, TSB, M63. - Preparación de disoluciones y diluciones - Mantenimiento del laboratorio. - Cultivo y siembra de E. coli y P. putida. - Conjugación y transformación bacteriana.

    • Fundación para la Formación e Investigación Sanitarias de la Región de Murcia

      May 2024 - now
      Bioinformática - Técnico de apoyo a la investigación

      Cardiología Clínica y Experimental

  • Licenses & Certifications

    • Fundamentals of Deep Learning

      NVIDIA
      May 2022
    • First Certificate in English (Nivel B2)

      Cambridge University Press & Assessment English